新基因TSBAG的生物信息学分析及其在小鼠睾丸组织中的表达

编号 zgly0000484215

文献类型 期刊论文

文献题名 新基因TSBAG的生物信息学分析及其在小鼠睾丸组织中的表达

作者 余振东  唐爱发  桂耀庭  张立兵  张键荣  郭新  蔡志明 

作者单位 北京大学深圳医院男性生殖医学实验室 

母体文献 生殖与避孕 

年卷期 2007,27(1)

页码 12-15

年份 2007 

分类号 Q954.434 

关键词 基因芯片  克隆  TSBAG基因  精子发生  RT-PCR 

文摘内容 目的: 筛选与精子发生相关的睾丸特异性新基因, 并探讨其在精子发生过程中所起的作用。方法: 将不同发育阶段的小鼠睾丸组织cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片进行杂交, 通过杂交信号的比较, 筛选出差异表达的基因。用生物信息学软件对该基因进行生物信息学分析。RT-PCR分析该基因在小鼠不同发育阶段睾丸、小鼠不同组织中的表达。结果: 通过4日龄、9日龄、18日龄、35日龄、54日龄和6月龄小鼠睾丸的芯片信号比较筛选出一个差异表达功能未知的新基因(GenBank登录号: BC049770), 全长891bp, 含有702bp的完整ORF, 编码一个233个氨基酸、相对分子量为26.938kD的蛋白质, 我们将其命名为TSBAG(testis-specificBAG.1ikeprotein)。亚细胞定位预测显示, TSBAG基因可能在细胞核中表达。EBI功能域预测发现, 在蛋白质序列8-62处有一个BAG功能域。RT-PCR分析表明, TSBAG基因特异性表达于小鼠睾丸组织中且具有时序性表达。TSBAG蛋白在人的同源基因GenBank登录号为AY349359, 在233个氨基酸区域内有83%的同源性。结论: TSBAG基因在小鼠睾丸组织中特异性表达, 且与小鼠精子发生过程一致。