基于RNA-Seq分析幼虫5龄期至化蛹初期家蚕卵巢发育中的细胞进程相关基因

编号 zgly0001447846

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-Seq分析幼虫5龄期至化蛹初期家蚕卵巢发育中的细胞进程相关基因

作者 殷亚娟  曹广力  黄茉莉  薛仁宇  贡成良 

作者单位 苏州大学基础医学与生物科学学院  苏州大学现代丝绸国家工程实验室 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2013年06期

年份 2013 

分类号 S883 

关键词 家蚕  转录组测序  卵巢发育  卵子发生  细胞进程 

文摘内容 细胞进程(cellular processes)包括物质转运和分解代谢、细胞运动、细胞生长和死亡及细胞通讯。为了解细胞进程相关基因对家蚕卵巢发育的影响,对幼虫5龄期至化蛹初期的家蚕卵巢组织进行转录组测序(RNA-Seq)。将去除低值序列的clean reads定位到来自家蚕的参考mRNA序列后,经过京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现,5龄至化蛹初期的家蚕卵巢中约有405个与细胞进程相关的基因,并包含与果蝇卵巢发育相关基因高度同源的基因。在这些基因中,与细胞的物质运输和代谢过程相关的基因有198个,与细胞运动相关的基因有22个,与细胞的生长和死亡相关的基因有109个,与细胞通讯相关的基因有76个。推测家蚕卵巢中的这些基因的功能与果蝇中的同源基因功能类似。研究结果为解析家蚕的卵巢发育及卵子发生的分子机制提供了新线索。