甜瓜STK类R基因同源序列的克隆与分析

编号 zgly0001579567

文献类型 期刊论文

文献题名 甜瓜STK类R基因同源序列的克隆与分析

作者 张志忠  孙志浩  蓝茂锋 

作者单位 福建农林大学园艺学院 

母体文献 植物资源与环境学报 

年卷期 2012年03期

年份 2012 

分类号 S652 

关键词 甜瓜  丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶  抗病基因同源序列  氨基酸序列  克隆  同源性 

文摘内容 以植物丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类(serine-threonine kinase,STK)抗病基因产物催化结构域Ⅰ和Ⅸ的保守氨基酸序列(FGK/V/L/SVYK/RG,DY/IYSF/YGV/I/M)设计简并引物,对甜瓜(Cucumis melo L.)基因组DNA进行PCR扩增,得到大约500 bp的目的条带,通过重组质粒克隆并经PCR检测后得到12条不同的DNA序列,命名为tg1～tg12,其中tg2、tg5、tg9和tg12(Genbank登录号为JN646853～JN646856)可以编码完整的氨基酸序列。Blast分析结果显示:4条序列均具有ATP结合部位、底物结合部位和激酶结构域的活化环(A-loop)等,属于典型的蛋白激酶基因家族,可能是STK类R基因的同源序列片段;4条序列与蓖麻(Ricinus communis L.)的STK同源性均较高。氨基酸序列比对结果显示tg2、tg5、tg9和tg12均具有R基因的9个保守结构域,为STK类候选抗病基因类序列。分子系统树显示tg2、tg5、tg9和tg12与已知的R基因(Pto、Lr10和Lectin)在氨基酸水平上的相似性仅为33.5%～53.4%,且4个甜瓜同源序列的氨基酸相似性也较低,表明甜瓜RGAs标记可能具有较高的特异性。