苜蓿钙依赖蛋白激酶家族的生物信息学分析

编号 zgly0001566480

文献类型 期刊论文

文献题名 苜蓿钙依赖蛋白激酶家族的生物信息学分析

作者 龚记熠  张宇斌  李菲  何小红  张习敏  乙引 

作者单位 贵州师范大学生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年09期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S541 

关键词 蒺藜苜蓿  CDPKs基因家族  进化  表达模式 

文摘内容 钙元素在植物体内具有重要的生物学作用,调控细胞壁形成、花粉管发育、生物和非生物胁迫信号传导等。钙依赖蛋白激酶(calcium dependent protein kinases,CDPKs)基因可以感知细胞内Ca2+浓度的变化并将它们转化为特异性磷酸化事件,启动下游信号传导过程。我们利用生物信息学数据和分析技术,鉴定出蒺藜苜蓿和天蓝苜蓿两个苜蓿品种中的CDPKs基因家族成员,并进行基因结构、进化和表达分析,初步预测了相关基因的功能。蒺藜苜蓿基因组中存在25个CDPKs基因,这些基因分成4个进化类群。蒺藜苜蓿CDPKs基因进化关系与拟南芥对应基因较近,与水稻较远。蒺藜苜蓿1号染色体上聚集的3个CDPKs基因Medtr1g041150、Medtr1g054865、Medtr1g055255序列高度相似,可能是1个基因扩增而来。利用已有的蒺藜苜蓿基因芯片表达数据,我们分析了蒺藜苜蓿CDPKs基因在不同器官以及不同处理下的表达情况,发现了多个与蒺藜苜蓿耐盐、抗根腐病菌侵染和根瘤生长过程相关的基因。