MADS-box基因家族在蒺藜苜蓿的全基因组分析

编号 zgly0001624459

文献类型 期刊论文

文献题名 MADS-box基因家族在蒺藜苜蓿的全基因组分析

作者 张军  宋丽莉  郭东林  郭长虹  束永俊 

作者单位 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 

母体文献 草业学报 

年卷期 2014年06期

年份 2014 

分类号 S541.9 

关键词 蒺藜苜蓿  MADS-box  系统进化分析  基因复制  表达模式 

文摘内容 MADS-box基因家族是植物体内的重要转录因子,它们广泛地调控着植物生长、发育和生殖等过程。本研究以蒺藜苜蓿基因组数据为材料,采用结构域搜索方法,鉴定了138个MADS-box基因。通过序列比对系统进化分析,将它们分成两大类:Ⅰ型(92个)和Ⅱ型(46个)。同时,通过染色体定位分析发现,134个MADS-box基因定位在染色体上,还有4个MADS-box基因定位在尚未完成最终拼接的超长片段上。蒺藜苜蓿的MADS-box基因家族成员之间存在大量的基因重复,特别是Ⅰ型MADS-box基因,通过基因复制,MADS-box基因家族在染色体上形成多个密集的MADS-box基因簇。对蒺藜苜蓿的RNA-seq表达谱数据分析,发现MADS-box基因在心皮组织、花器官等组织中表达量较高,这表明蒺藜苜蓿的MADS-box基因家族广泛地参与苜蓿组织分化、发育以及生殖等过程的调控,这将为进一步揭示MADS-box类转录因子在蒺藜苜蓿中作用机制提供了重要的参考。