蒺藜苜蓿和天蓝苜蓿ARFs类转录因子的鉴定和特征分析

编号 zgly0001566386

文献类型 期刊论文

文献题名 蒺藜苜蓿和天蓝苜蓿ARFs类转录因子的鉴定和特征分析

作者 李菲  何小红  张习敏  龚记熠  乙引 

作者单位 贵州师范大学生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S541 

关键词 蒺藜苜蓿  ARFs基因家族  进化  表达模式 

文摘内容 生长素应答因子(Auxin responsive factors)是植物内传导生长素信号、调控生长素响应的功能基因的表达过程中,起中心作用的重要转录因子,参与植物生长发育的各个方面的调控,包括组织分化、器官发生、顶端优势和根生成、趋向性等。我们利用豆科植物的模式作物,蒺藜苜蓿已有的全基因组序列数据,应用生物信息学的手段,对蒺藜苜蓿全基因组和天蓝苜蓿叶片转录组ARFs基因家族进行系统的分析和基因功能预测。共鉴定出34个完整的蒺藜苜蓿ARFs基因,其中27个基因有基因芯片的表达证据。天蓝苜蓿鉴定出11个完整的ARFs基因。染色体定位分析发现在蒺藜苜蓿第5染色体上聚集了6个基因结构和氨基酸序列均非常相似的ARFs。系统进化分析表明这6个基因在拟南芥中没有同源基因。拟南芥的部分ARFs在苜蓿中也没有同源基因。应用基因芯片数据进行基因表达分析表明蒺藜苜蓿的ARFs在不同器官特异性的表达。部分蒺藜苜蓿ARFs成员响应盐胁迫和菌根真菌侵染。Medtr8g100050不仅响应盐胁迫上调表达,菌根真菌侵染后也上调表达。