结缕草肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析

编号 zgly0000709949

文献类型 期刊论文

文献题名 结缕草肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析

学科分类 220.50;园林学

作者 王舟  宗俊勤  宣继萍  郭爱桂  刘建秀 

作者单位 南京农业大学生命科学学院  江苏省中国科学院植物研究所南京中山植物园 

母体文献 草业学报 

年卷期 2010,19(6)

页码 154-163

年份 2010 

分类号 Q943.2 S543.903 

关键词 结缕草  肌动蛋白基因  克隆  序列分析 

文摘内容 根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物, 提取结缕草叶片的总RNA, 进行RT-PCR。并采用RACE 技术扩增出1560bp的Actin基因全长cDNA 序列。序列分析表明, 该基因的开放阅读框(ORF)为1134bp, 编码377个氨基酸, 5′非编码区117bp, 3′非编码区309bp。所得序列与GenBank中收录的其他植物肌动蛋白核苷酸序列的一致性均在85%以上, 氨基酸序列的一致性高达97%以上。将其命名为犣犼犃犆犜, GenBank登录号为GU290545。根据高等植物肌动蛋白相似性构建的系统进化树显示, 结缕草肌动蛋白与大麦和圆锥小麦肌动蛋白之间的亲缘关系最为密切, 在进化中分化时间最为接近。进一步分离克隆了结缕草Actin基因的基因组DNA 序列(登录号GU290546), 它由4个外显子和3个内含子组成。本研究有助于揭示植物Actin基因家族的进化历史, 为研究植物Actin基因家族功能和进化上的多样性奠定理论基础, 同时也为开展草坪草和牧草Actin基因的功能分析和利用研究提供参考。