海洋微生物ZD02信号降解酶基因aiiA克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0000821855

文献类型 期刊论文

文献题名 海洋微生物ZD02信号降解酶基因aiiA克隆及其生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 丁贤  孙威文  张殿昌  翁雄  林黑着  周世宁 

作者单位 中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源开发利用重点实验室 

母体文献 生态学杂志 

年卷期 2013(8)

页码 2056-2061

年份 2013 

分类号 Q938 

关键词 海洋细菌  群体感应信号降解酶  aiiA基因 

文摘内容 根据细菌群体感应信号降解酶(AiiA)基因设计简并引物, 从海洋微生物ZD02基因组中扩增编码AiiA的基因aiiA, 筛选其阳性克隆, 测序后分析其基因序列。结果表明: 筛选到的阳性克隆ZD02aiiA序列全长753 bp(Genbank登录号: KC756214), 存在一个开放阅读框(ORF), 编码由250个氨基酸残基组成的多肽, 预测分子量为28.1 kDa, 蛋白等电点为4.78。由该序列推导得到的氨基酸残基序列含有一个保守结构域(Lactamase-B) (34AA～235AA), 并预测了AiiA的三级结构。以上研究为该序列的重组表达及其相关活性研究奠定了基础。