广叶绣球菌DASH型隐花色素同源基因Slcry1的序列与表达分析

编号 zgly0001655171

文献类型 期刊论文

文献题名 广叶绣球菌DASH型隐花色素同源基因Slcry1的序列与表达分析

作者 杨驰  马璐  肖冬来  应正河  江晓凌  林衍铨 

作者单位 福建省农业科学院食用菌研究所  特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S646 

关键词 广叶绣球菌  隐花色素  Slcry1  食药用菌 

文摘内容 用关键词DNA photolyase (pfam 00875)和FAD binding domain of DNA photolyase (pfam03441)搜索广叶绣球菌(Sparassis latifolia)闽绣1号菌株基因组,找到一个候选基因——隐花色素同源基因Slcry1,PCR扩增得到该同源基因cDNA全长1755 bp,基因组全长为2279 bp;利用PROTPARAM预测SlCRY1蛋白含有584个氨基酸,相对分子质量为65800,等电点为8.94;利用SMART和Pfam预测其保守结构域,发现SlCRY1蛋白(584个氨基酸)包含一个DNA光解酶(DNA Photolyase)结构域和一个FAD结合(FAD binding)结构域;用MEGA7软件中的邻位相连法构建系统发育树,发现SlCRY1属于光解酶/隐花色素蛋白家族中的DASH(Drosophila,Arabidopsis,Synechocystis,and Homo species)型隐花色素;最后用荧光定量PCR检测该同源基因在广叶绣球菌不同发育阶段及光照处理下的表达量:在约300 lx白色LED光照下,基因Slcry1表达量随光照时间延长而增加;不同发育时期,Slcry1基因的表达水平为子实体>原基>菌丝。实验结果揭示:SlCRY1属于DASH型隐花色素,其表达量受到光照的诱导,且随广叶绣球菌的生长发育而上升。