中华猕猴桃基因组可变剪接事件鉴定及分析

编号 zgly0000995073

文献类型 期刊论文

文献题名 中华猕猴桃基因组可变剪接事件鉴定及分析

学科分类 220.35;野生动物保护与管理

作者 周晏秋  覃瑞  刘胜毅  李刚  黄军艳  董彩华  程晓晖  刘虹  童超波 

作者单位 中南民族大学武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室  中国农业科学院油料作物研究所  农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室 

母体文献 中国科学:生命科学 

年卷期 2015(3)

页码 289-300

年份 2015 

关键词 中华猕猴桃  可变剪接  基因组  维生素 

文摘内容 可变剪接使一个基因能产生多种m RNA成熟体,极大地增加蛋白多样性.采用中华猕猴桃基因组数据做参考数据,利用中华猕猴桃叶片和果实3个不同发育时期(未成熟、半成熟和成熟期)的转录组数据,从中华猕猴桃基因组(39040个基因)中共鉴定出11651个基因(占总基因数的29%)对应的32180个可变剪接事件.在可变剪接不同类型中,内含子保留类型的发生频率最高,占50%以上;3′可变位点类型频率约为5′端可变类型的2倍。