紫花苜蓿几丁质酶基因MsChiⅣ克隆及序列分析

编号 zgly0001371295

文献类型 期刊论文

文献题名 紫花苜蓿几丁质酶基因MsChiⅣ克隆及序列分析

作者 王步云  李聪  王涌鑫  关宁  苗丽宏 

作者单位 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种研究室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2009年02期

年份 2009 

分类号 S541.9 

关键词 几丁质酶基因  紫花苜蓿  克隆  分析 

文摘内容 本研究根据截形苜蓿(Medicago truncatula)根部的几丁质酶基因保守序列(GenBank登录号:AF167328)设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法得到了紫花苜蓿(Medicago SativaL.)根部几丁质酶基因保守序列。根据得到的保守序列设计3’端和5’端特异引物,分别从3’端和5’端扩增延长该片段,最后通过序列拼接获得紫花苜蓿根部一种几丁质酶基因的全长cDNA序列,命名为MsChiⅣ(GenBank登录号:FJ487629)。MsChiⅣ基因全长为1025bp,开放性阅读框全长为849bp,编码282个氨基酸,分子量为30.5kD,预测等电点为4.66,其结构包括信号肽、几丁质结合区、糖苷水解酶区,为Ⅳ类几丁质酶,属于几丁质酶第19家族,在氨基酸水平上与截形苜蓿几丁质酶蛋白同源性最高,达到98%。蛋白结构分析表明该基因编码蛋白为非跨膜蛋白,存在于细胞质中。