玉米PLCs基因家族鉴定及表达谱分析

编号 zgly0001640025

文献类型 期刊论文

文献题名 玉米PLCs基因家族鉴定及表达谱分析

作者 董洁静  徐晶宇  林俊俊  贺琳  赵长江  李佐同 

作者单位 黑龙江八一农垦大学农学院  黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室  黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心  黑龙江省普通高校寒地作物种质改良与栽培重点实验室 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2018年06期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S513 

关键词 玉米  PLC  非生物逆境  表达分析  生物信息学 

文摘内容 磷脂酶C（phospholipase C,PLC）是一类能够水解磷脂的酶,作为磷脂酶家族中的一员,在调节植物生长及响应逆境胁迫中发挥重要作用。本文通过对ZmPLCs蛋白的系统发育、其基因结构及启动子中的逆境相关顺式作用元件数量,以及基因的组织特异性表达模式等生物信息学进行研究;并用NaHCO3和低温处理玉米转录组数据,构建ZmPLCs基因表达谱。结果显示,在玉米基因组水平上共鉴定出9个玉米PLCs基因,基于玉米PLCs水解底物的不同,9个ZmPLCs基因被分为2个亚族,分别定位在玉米的1、2、3、5和9号染色体上。ZmPI-PLCs编码蛋白包含典型的X、Y和C2结构域,ZmNPCs蛋白包含典型的磷酸酯酶结构域,ZmPLCs蛋白N端由延长链和螺旋结构组成,多定位于线粒体和叶绿体。ZmPLCs基因替换发现ZmPLCs家族可能是通过变异进行扩增的。在9个ZmPLCs基因启动子上包括脱落酸、盐和低温等激素和非生物胁迫相关元件高度富集,转录组数据分析ZmPI-PLC2和ZmNPC2上调响应Na HCO3,ZmPI-PLC5和ZmNPC3上调响应低温,ZmPI-PLC3和ZmPI-PLC4与玉米根系发育有关,这与基因表达模式相印证,进一步表明玉米PLCs基因参与植物对多种非生物逆境的响应,以及作物对非生物抗性利用的潜在应用价值。