非生物逆境胁迫相关NAC转录因子的生物信息学分析

编号 zgly0000792582

文献类型 期刊论文

文献题名 非生物逆境胁迫相关NAC转录因子的生物信息学分析

作者 李伟  韩蕾  钱永强  巨关升  孙振元 

作者单位 中国林业科学研究院林业研究所/国家林业局林木培育重点实验室 

母体文献 西北植物学报 

年卷期 2012,32(3)

页码 454-464

年份 2012 

分类号 Q789 

关键词 非生物逆境  NAC转录因子  生物信息学 

文摘内容 通过生物信息学手段,对22种NAC蛋白(14种非生物逆境胁迫相关NAC蛋白、8种涉及不同生物学功能的NAC蛋白)进行氨基酸序列比对和系统发生树构建,对14种非生物逆境胁迫相关NAC蛋白氨基酸组成、理化性质、亲/疏水性、保守结构域、亚细胞定位、二级结构及三级结构等进行了分析、预测。结果显示,22个NAC蛋白中,非生物逆境相关的NAC蛋白聚成一类,其余NAC蛋白聚为另一类;非生物逆境胁迫相关的NAC蛋白序列分析显示,N-端具有A、B、C、D、E 5个保守的亚结构域,共同组成NAC结构域,C-端含有多个保守的酸性氨基酸位点,具有转录激活功能,同时蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点;非生物逆境胁迫相关NAC蛋白主要亲水区域位于A、C、D亚域,大多定位于细胞核,个别定位于细胞质或线粒体,二级结构则以α-螺旋和β-折叠片为主;拟南芥RD26和ANAC三级结构上的一致性暗示了功能上的相似。