广西局地西番莲病毒病的病原鉴定及优势病毒分析

编号 zgly0001714436

文献类型 期刊论文

文献题名 广西局地西番莲病毒病的病原鉴定及优势病毒分析

作者 谢慧婷  李战彪  崔丽贤  秦碧霞  刘丽辉  林珊宇  陈锦清  蔡健和 

作者单位 广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所  广西作物病虫害生物学重点实验室 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S436.67 

关键词 西番莲  小RNA测序  黄瓜花叶病毒  夜来香花叶病毒  东亚西番莲病毒 

文摘内容 在广西采集表现斑驳、花叶症状疑似病毒病的西番莲叶片样品,利用小RNA测序技术,结合生物信息学分析,鉴定侵染西番莲的病毒种类。参考测序结果采用DAS-ELISA和RT-PCR方法对2015～2018年间采集的385份疑似病毒病样品进行检测,分析引发广西西番莲病毒病的优势病毒种类。结果显示:小RNA共获得20 921 061 clean reads,拼接获得560个contigs,其中99个contigs被注释为夜来香花叶病毒(telosma mosaic virus,TeMV),97个contigs被注释为黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV),69个contigs被注释为东亚西番莲病毒(East Asian passiflora virus,EAPV),12个contigs被注释为大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)。提取送测序的同批样品叶片的总RNA进行RT-PCR验证,可检测出TeMV、EAPV和CMV 3种病毒,未检出SMV。采用DAS-ELISA和RT-PCR对采集的样品进行检测,结果发现284份样品为阳性样品,检出率为73.76%,其中TeMV的检出率最高为64.16%,其次为EAPV和CMV,检出率分别为41.30%和11.43%;3种病毒存在复合侵染现象,其中TeMV+EAPV的检出率最高为24.94%,TeMV+CMV的检出率为4.16%,EAPV+CMV的检出率为0.26%,3种病毒复合侵染的检出率为4.94%。