中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及豆科UPF0114基因家族成员分析

编号 zgly0001669678

文献类型 期刊论文

文献题名 中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及豆科UPF0114基因家族成员分析

作者 杨杞  牛肖翠  王瑞刚  李国婧 

作者单位 内蒙古农业大学生命科学学院  内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室  内蒙古自治区抗逆植物遗传资源利用与分子改良科技创新团队 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2019年03期

年份 2019 

分类号 Q943.2 

关键词 CiUPF0114  基因克隆  中间锦鸡儿  基因家族  进化分析 

文摘内容 本研究克隆了中间锦鸡儿一个CiUPF0114基因,该基因编码框长876 bp,编码291个氨基酸的蛋白质,预测等电点9.83,分子量32.13 kD。利用荧光定量PCR检测发现,在干旱、脱水和冷处理后,CiUPF0114基因转录水平的表达量均明显上调。通过全基因组筛选,获得了29个来自于8种豆科植物以及模式植物拟南芥和水稻中的UPF0114基因家族成员,并对其进行了系统进化分析、基因结构和保守基序分析。系统进化分析将UPF0114基因分成A和B两个亚家族,A亚家族又分成A1和A2两个组,本研究中克隆的中间锦鸡儿CiUPF0114属于B亚家族成员。通过对蛋白长度、结构域数量、分子量、等电点、基因结构和保守基序的分析发现,29个UPF0114基因差异不大,说明该基因家族成员在进化上相对保守。该研究为进一步验证CiUPF0114基因的功能奠定了基础。