杂交构树Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列的多样性分析

编号 zgly0001652580

文献类型 期刊论文

文献题名 杂交构树Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列的多样性分析

作者 白杨  林晓飞  张文波 

作者单位 内蒙古农业大学林学院  内蒙古大学生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年22期

年份 2018 

分类号 S792.99 

关键词 杂交构树  逆转座子  逆转录酶  遗传多样性 

文摘内容 为深入分析杂交构树的遗传多样性,开发可靠的分子标记,采用同源克隆技术分离了Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列,并对其同源性及系统进化关系进行了分析。所分离的40条序列(命名为BpRT1-40)长度为410～420 bp,均富含AT碱基,序列间的同源性范围为14.2%～99.3%,显示较高异质性。氨基酸序列分析发现,其中有19条序列发生了终止密码子突变、9条发生了移框突变,表明终止密码子突变和移框突变可能是导致杂交构树逆转座子异质性的主要原因。系统进化分析显示:该40条氨基酸序列由2个基因家族组成,其中FamilyⅠ包含38条序列,由5个亚家族组成,各亚家族成员间亲源关系较近;FamilyⅡ包含2条序列,它们与其它序列亲缘关系较远。与其他植物Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶进行系统进化分析发现,所克隆的序列与绿豆、荸荠、兴安落叶松、皱皮椒草、油棕、黄瓜、向日葵等植物的Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列具有较近的亲缘关系。以上结果说明:FamilyⅠ是杂交构树中广泛存在的逆转座子家族,它们可能在杂交构树的遗传进化中发挥着重要的作用。FamilyⅡ中的2条序列同源性较低,同时与其它物种的Ty3-gypsy类逆转座子转录酶的遗传距离也较远,由此可以说明FamilyⅡ的起源比较古老,特异性强。本研究为进一步合理地利用杂交构树资源提供理论基础。