沙地柏逆转座子的多样性分析

编号 zgly0000914674

文献类型 期刊论文

文献题名 沙地柏逆转座子的多样性分析

作者 余利敏  林晓飞  张文泉  张国盛  张文波 

作者单位 内蒙古农业大学林学院  内蒙古大学生命科学学院  贵州凯里学院 

母体文献 林业资源管理 

年卷期 2014(2)

页码 155-160

年份 2014 

关键词 沙地柏  逆转座子  逆转录酶  多样性 

文摘内容 为了开发沙地柏(Sabina vulgaris)的逆转座子基因资源,分析其在沙地柏基因组中的多样性和系统进化关系,采用兼并-PCR技术克隆了22条Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列。所克隆的核苷酸序列除去两端引物后的长度范围为239~247bp,同源性范围为49.6%~98.4%,显示出较高的异质性。核苷酸聚类分析结果显示,该22条序列由5个家族组成;氨基酸序列分析结果显示,有7条序列出现终止密码子突变,4条序列表现移框突变;且将这些逆转录酶的氨基酸序列与其它物种同一类型逆转录酶的氨基酸序列进行聚类分析表明,它们可能与其它物种的Ty1-copia逆转录酶有共同的起源。