家蚕黑胸败血芽孢杆菌基因组测序及结构分析和功能注释

编号 zgly0001468482

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕黑胸败血芽孢杆菌基因组测序及结构分析和功能注释

作者 程廷才  林平  金盛凯  付博华  龙仁文  夏庆友 

作者单位 家蚕基因组生物学国家重点实验室·西南大学 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2014年06期

年份 2014 

分类号 S884.42  Q789 

关键词 家蚕细菌病  黑胸败血芽孢杆菌  基因组  测序  序列结构  功能注释  共线性 

文摘内容 黑胸败血芽孢杆菌(Bacillus bombyseptieus)是家蚕细菌性败血病的常见病原之一。在获得黑胸败血芽孢杆菌基因组完成图的基础上,对该菌株的基因组测序、基因组序列结构特征以及基因功能注释等信息进行分析。该菌株的基因组测序数据量达到2.1 Gb,基因组覆盖度超过360倍,基因组组装大小为5.87 Mb,包含2个复制子——1个核基因组(5 295.783 kb)和1个质粒基因组(577.809 kb);基因组重复序列比率为1.179 2%,包含136个非编码RNA和5 298个编码基因。测序得到的基因组数据通过KEGG和COG数据库进行功能注释,主要与物质转运、氨基酸代谢、碳水化合物代谢等相关。基因组共线性分析表明黑胸败血芽孢杆菌与芽孢杆菌属细菌的亲缘关系较近。该研究结果将为鉴定黑胸败血芽孢杆菌的毒力因子以及研究其致病机制和与宿主的相互作用提供重要数据支撑。