四种de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较

编号 zgly0001422443

文献类型 期刊论文

文献题名 四种de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较

作者 刘宗林  许金山  周泽扬 

作者单位 重庆师范大学重庆市动物生物学重点实验室  重庆师范大学活性物质生物技术教育部工程研究中心  西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室 

母体文献 蚕学通讯 

年卷期 2012年03期

年份 2012 

分类号 S885.1 

关键词 微粒子病  柞蚕微孢子虫  de novo组装  基因组 

文摘内容 柞蚕是一类以柞树叶为食料的经济类吐丝结茧昆虫,柞蚕微孢子是寄生在柞蚕体内的一种微孢子虫,是柞蚕微粒子病的病原,其主要通过食下传染或者母体传染来感染柞蚕。目前在分子水平上对柞蚕微孢子虫的研究还很少,本研究通过比较分析四种常见的de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组的组装,结果显示不同的软件组装的结果相差甚远,由此表明由于柞蚕基因组本身结构的特殊性及组装软件的针对性,导致了组装质量的差异性。本研究对于今后昆虫微孢子虫基因组的组装软件的选择优化提供了重要的参考。