大青杨PuZFP103基因的序列特征及逆境胁迫的表达分析

编号 zgly0001727437

文献类型 期刊论文

文献题名 大青杨PuZFP103基因的序列特征及逆境胁迫的表达分析

作者 张馨  马苗苗  吕婉秋  LEE Joobin  杨静莉 

作者单位 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室 

母体文献 南京林业大学学报:自然科学版 

年卷期 2021,45(1)

页码 36-44

年份 2021 

分类号 S722.5 

关键词 大青杨  PuZFP103基因  逆境胁迫  生物信息学  RT-QPCR 

文摘内容 【目的】通过研究大青杨(Populus ussuriensis)PuZFP103基因的序列特征及其在不同组织部位、激素处理与胁迫应答中的表达特性,为揭示PuZFP103在大青杨生长发育中的功能提供依据。【方法】利用各种生物信息学方法对PuZFP103基因进行分析,采用实时荧光定量PCR(real time quantitative polymerase chain reaction,RT-qpCR)技术分析PuZFP103基因在不同组织、激素处理与胁迫应答中的表达模式,并用基因枪轰击法进行亚细胞定位分析。【结果】生物信息学分析发现,PuZFP103 CDS序列全长504 bp,编码168个氨基酸。分析得出PuZFP103蛋白含有ZnF-C2H2结构域,其二级结构中α螺旋、无规则卷曲和β-折叠分别占24%、84%和1%。进化树构建图显示,其与同属毛果杨、胡杨、毛白杨及番木瓜聚类到一起,亲缘关系最近。RT-qPCR分析结果显示,NaCl、脱落酸(abscisic acid,ABA)和PEG 6000胁迫处理后PuZFP103基因在大青杨叶和根中的表达量在大多数时间内相对于未处理都有所提高。另外,PuZFP103基因定位于细胞核中。【结论】PuZFP103基因在NaCl、ABA和PEG 6000胁迫处理后呈正调控的应答模式,可能参与了大青杨对渗透胁迫的代谢途径或信号传导,属于逆境胁迫下的调控因子。本研究初步证明大青杨PuZFP103基因与胁迫响应相关,但是关于其信号传导与调控机制需进一步研究。