毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定

编号 zgly0001680310

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定

作者 蒋政勤  周明兵  郑浩  季航  徐芷馨 

作者单位 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室  浙江农林大学浙江省竹资源与高效利用协同中心 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S795.7 

关键词 植物学  毛竹  LTR反转录转座子  生物信息学  逆境胁迫  转录活性 

文摘内容 长末端重复序列（LTR）反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸（DNA）序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7。该转座子全长为6 073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支,LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前。对毛竹实生苗分别进行辐照（30, 50, 70 Gy）,甲基化抑制剂（50, 100, 150μmol·L-1）,高温（42℃）,低温（4℃）,高盐(0.1, 0.2, 0.3 mol·L-1)等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应（PCR）检测,PHRE7在INT, RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2～0.3 mol·L-1高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、高温、低温、高盐0.1～0.2 mol·L-1)的表达量都随处理强度呈上升趋势。这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化。图7表2参42