2012年-2014年闽西地区PRRSV流行株ORF5基因遗传变异分析

编号 zgly0001528550

文献类型 期刊论文

文献题名 2012年-2014年闽西地区PRRSV流行株ORF5基因遗传变异分析

作者 黄春芳  刘建奎  龚丽珍  杨炳辉  曾建平  陈安妮  陈小燕 

作者单位 福建省龙岩学院生命科学学院福建省家畜疫病防治与生物技术重点实验室福建省生猪疫病防控工程技术研究中心 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2016年07期

年份 2016 

分类号 S852.651 

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒  ORF5基因  反转录-聚合酶链反应  遗传变异 

文摘内容 为了研究2012年-2014年闽西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特性和变异规律,对分离自闽西多个地区25份疑似PRRS病料的10个PRRSV分离株,应用RT-PCR对其中ORF5基因进行扩增及序列分析,从而了解闽西地区PRRSV的遗传变异性。结果表明,10个毒株均为美洲型PRRSV,9株PRRSV ORF5基因全长为603bp(FJ05为600bp),10个毒株ORF5基因之间的核苷酸同源性为88.4%~99.3%;与VR-2332、MLV和CH-1a毒株的核苷酸同源性为88.3%~98.8%,与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88.9%~99.0%,与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为63.8%~65.0%。ORF5基因推导氨基酸序列变异主要发生在9-40位和58-62位,10株PRRSV ORF5氨基酸同源性为88.5%~99.5%;与VR-2332、MLV和CH-1a的氨基酸同源性为87.5%~98.5%,与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88.0%~99.5%,与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为56.6%~59.2%。遗传进化树表明,闽西地区PRRSV可以分为疫苗株(1株,10%)、中等毒力PRRSV(1株,10%)和HP-PRRSV(8株,80%)3个亚群,其中以HP-PRRSV为主,表明闽西地区PRRSV流行毒株呈现遗传变异多样性。