2010年-2011年我国五省PRRSV分离株ORF5基因遗传变异分析

编号 zgly0001423028

文献类型 期刊论文

文献题名 2010年-2011年我国五省PRRSV分离株ORF5基因遗传变异分析

作者 刘沫飞  李蕾  郑辉  李岚  王赛赛  吴发兴  李晓成  王洪斌  黄保续 

作者单位 东北农业大学  中国动物卫生与流行病学中心  云南农业大学  福建农林大学 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2012年12期

年份 2012 

分类号 S852.659.6 

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒  ORF5基因  病毒分离  遗传变异 

文摘内容 为了解2010年-2011年间我国5省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特性及变异规律,应用Mcar-145细胞分离得到15株PRRSV,通过RT-PCR方法对15株PRRSV的ORF5基因进行扩增和序列分析。依据NCBI所下载的标准序列设计一对引物,对ORF5全长进行扩增(603bp),分离株之间的核苷酸同源性为98.8%～99.9%,核苷酸推导的氨基酸同源性为95.5%～99.5%。15株PRRSV分离株与美洲型的PRRSV同源性较高,可推断均属美洲型。其中9株ORF5(151)氨基酸位点发生与HB-1相同的变异,即R151→K151,其余6株ORF5(151)氨基酸位点与JAX1相同,即ORF5(151)为R。系统进化树表明,BFLN3-2010、BFSD1-2011和BFAH2-2011 3株与CH-1a在同一分支,属于第2亚群,BFLN2-2010等12株与JAX1在同一分支,属于第4亚群。