红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析

编号 zgly0000458209

文献类型 期刊论文

文献题名 红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析

学科分类 220.99;林学其他学科

作者 兰小中  孙敏 

作者单位 西藏大学农牧学院动物科技系生物技术教研室  西南大学生命科学学院 

母体文献 西南农业大学学报 

年卷期 2006,28(4)

页码 537-543

年份 2006 

分类号 S791.49 

关键词 西藏红豆杉  紫杉醇  香叶基香叶基焦磷酸合成酶  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 20碳单位的香叶基香叶基焦磷酸是紫杉醇生物合成的直接前体, 它由香叶基香叶基焦磷酸合成酶催化生成。采用RT-PCR技术从高原植物西藏红豆杉中克隆了编码香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因, 命名为TwGGPPS(GenBank登录号: DQ364604)。该基因编码区长为1182bp, 编码393个氨基酸的多肽; 生物信息学分析表明TwGGPPS定位于质体, 在其氨基端具有长为18个氨基酸的质体转运肽; TwGGPPS属于异戊烯基转运酶家族, 具有该酶家族特有的2个天冬氨酸富集基序; 分子系统进化分析表明植物的GGPPS分为被子植物和裸子植物2种类型, TwGGPPS属于裸子植物类型的GGPPS; 对TwGGPPS的蛋白质结构模拟分析结果表明, TwGGPPS由大量的α-螺旋通过随机卷曲连接而成, 这些α-螺旋环绕形成一个袋状空腔, 其空腔口部为底物结合与碳链延伸的活性部位。对TwGGPPS基因组结构的分析表明该基因没有内含子。该基因的克隆和分析为实现紫杉醇的基因工程提供了一个重要的基因和作用靶点。