牦牛和水牛全基因组微卫星分布规律及其比较分析

编号 zgly0000943427

文献类型 期刊论文

文献题名 牦牛和水牛全基因组微卫星分布规律及其比较分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 戚文华  蒋雪梅  杜联明  肖国生 

作者单位 重庆三峡学院生命科学与工程学院  重庆三峡学院环境与化学工程学院  四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2015(7)

页码 1406-1412

年份 2015 

关键词 牦牛  水牛  基因组  微卫星序列  生物信息学 

文摘内容 微卫星(simple sequence repeats,SSRs)广泛分布于原核生物和真核生物基因组中,包括编码区和非编码区,是最常用的分子标记。本文利用生物信息学方法搜索和统计了牦牛和水牛全基因组中完整型SSRs序列,并对其生物信息学特征进行比较分析。牦牛和水牛全基因组中SSRs总数量分别为968 134个和1 052 443个,占其全基因组长度的比例分别为5.80‰和5.69‰。牦牛和水牛全基因组SSRs总丰度(366.01 vs 371.07个/Mb)和总密度(5 686.00 vs 5 799.34 bp/Mb)基本接近。