编号 zgly0000556295
文献类型 期刊论文
文献题名 狐貉源犬瘟热病毒融合蛋白基因的同源性分析
作者单位 东北林业大学
母体文献 东北林业大学学报
年卷期 2008,36(3)
页码 70-72,77
年份 2008
分类号 S858.92
关键词 犬瘟热病毒 F基因 基因克隆 同源性分析
文摘内容 2004—2006年,从黑龙江省和内蒙等地发病饲养狐、貉中分离获得6株犬瘟热病毒(CDV),分别命名为MS01、SC01、ZD01、GN01、HL01、NM01分离株。根据Genbank上发表的的CDV F基因序列设计了1对特异性引物,应用RT—PCR方法分别对6个分离株F基因进行克隆、测序,并推导其氨基酸序列,绘制出F基因的遗传进化树。结果表明:6个CDV分离株F基因的开放阅读框架(ORF)均为1989bp,编码663个氨基酸,蛋白结构中的13个Cys残基住点和4个潜在的糖基化位点均高度保守,其裂解住点的氨基酸序列为220R—R—Q—R-224R。遗传进化分析表明:6个分离株与CDV代表强毒株A75/17属于同一谱系,均为强毒株。其中,HL01株与海豹瘟热病毒2型(PDV-2)亲缘关系较近,与其它5个分离株关系相对较远。