苹果MdGLRs家族基因生物信息学鉴定和表达分析

编号 zgly0001420119

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果MdGLRs家族基因生物信息学鉴定和表达分析

作者 罗华  胡大刚  张连忠  郝玉金 

作者单位 山东农业大学园艺科学与工程学院国家苹果工程技术研究中心农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2012年03期

年份 2012 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  谷氨酸受体  MdGLRs家族基因  序列分析  生物信息学  表达分析 

文摘内容 利用生物信息学策略对苹果MdGLRs家族基因编码蛋白的氨基酸序列的基本特征、二级结构、跨膜区域、亲疏水性、基因亚细胞定位及保守结构域进行了预测和分析,与拟南芥AtGLRs家族的20个基因进行了氨基酸序列比对和进化树分析,并对这些基因在不同营养生长器官中进行了表达分析。结果表明,苹果MdGLRs家族包含32个基因,分为3个亚族,大部分基因编码800个氨基酸以上,多含有3个跨膜区域,二级结构主要以α–螺旋、无规则卷曲、折叠延伸链为主;亚细胞定位预测发现,MdGLRs蛋白主要定位在内质网和质膜上;MdGLRs蛋白的保守结构域是S1-M1-M2-M3-S2-M4;大多数基因在根、茎、叶中普遍都有表达,在叶中的表达量最高。