紫丁香查尔酮异构酶基因SoCHI的克隆及表达分析

编号 zgly0001645348

文献类型 期刊论文

文献题名 紫丁香查尔酮异构酶基因SoCHI的克隆及表达分析

作者 王蕊  李彦慧  郑健 

作者单位 北京农学院园林学院北京林果业生态环境功能提升协同创新中心  河北农业大学园林与旅游学院 

母体文献 植物资源与环境学报 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S685.26 

关键词 紫丁香  查尔酮异构酶基因  基因克隆  序列分析  同源性分析  表达特性 

文摘内容 采用RACE技术从紫丁香(Syringa oblata Lindl.)花中克隆获得查尔酮异构酶基因(CHI)的cDNA全长序列,命名为SoCHI,其编码的蛋白质为SoCHI蛋白。序列分析结果表明:SoCHI基因的开放阅读框(ORF)长度为684bp,编码227个氨基酸残基,并且,该基因全部由外显子构成,无内含子。SoCHI蛋白理论相对分子质量24 988,理论等电点p I 5.53,不稳定系数为47.58,平均亲水指数为-0.096,并包含2个氢键结合位点、2个活性催化位点和7个底物结合位点;在该蛋白质的二级结构中,α-螺旋、延伸链和无规则卷曲分别占该蛋白质氨基酸残基总数的31.7%、20.3%和48.0%。同源性比对结果表明:紫丁香与其他9种植物CHI蛋白的同源性很高(均在76%以上),与同科[木犀科(Oleaceae)]植物桂花(Osmanthus fragrans Lour.)和油橄榄(Olea europaea Linn.)CHI蛋白的同源性更高(达88%)。实时荧光定量PCR扩增结果表明:SoCHI基因的相对表达量在紫丁香的嫩叶中最高,在成熟叶中次之;该基因的相对表达量在紫丁香花发育过程中先上升后下降,并在花蕾期达到最高。研究结果显示:SoCHI基因编码的氨基酸序列相对保守,且其表达与紫丁香花呈色关系密切。