利用SCoT标记分析不同秋眠型苜蓿的遗传多样性

编号 zgly0001625335

文献类型 期刊论文

文献题名 利用SCoT标记分析不同秋眠型苜蓿的遗传多样性

作者 何庆元  王吴斌  杨红燕  向仕华  周丽英  王松华 

作者单位 安徽科技学院生命科学学院  南京农业大学大豆研究所国家大豆改良中心作物遗传与种质创新国家重点实验室 

母体文献 草业学报 

年卷期 2012年02期

年份 2012 

分类号 S541.9 

关键词 苜蓿  SCoT  条件优化  秋眠型  遗传多样性 

文摘内容 用L16(45)正交实验设计研究模板DNA、dNTPs、Mg2+、Taq酶和引物5个因素的浓度对SCoT扩增迁移率重现率的影响。结果表明,在20μL反应体系中,2.5ng/μL DNA、1.00mmol/L Mg2+、1.20U Taq酶、0.40mmol/L dNTPs和0.30μmol/L浓度的引物最为稳定,重现率达到100%。利用最优反应体系从50条引物中筛选出13条扩增效果好的引物,将它们分别扩增34个苜蓿品种,共检测到103个SCoT标记,其中92个位点具有多态性。聚类分析表明,从安徽和江苏两地收集的野生南苜蓿和栽培苜蓿的遗传距离最远,单独聚为一类;其余32个品种苜蓿在相似系数0.757附近分为3个亚群,秋眠型苜蓿品种主要分布在第Ⅱ亚群中,半秋眠型在3个亚群中都有分布,而非秋眠型苜蓿分布在第一和第二亚群中,表明SCoT标记的聚类结果在一定程度上能够反映苜蓿的秋眠型,但并不完全一致。