43份油菜菌核病抗性资源的SCoT、SSR与SRAP标记分析

编号 zgly0001570317

文献类型 期刊论文

文献题名 43份油菜菌核病抗性资源的SCoT、SSR与SRAP标记分析

作者 张羽  张晓娟  陈进  孙晓敏  张成兵 

作者单位 陕西理工学院生物科学与工程学院  陕西省汉中市农业科学研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S435.654 

关键词 油菜  SSR  SRAP  SCoT  遗传多样性 

文摘内容 【目的】探索SCoT、SSR和SRAP 3类分子标记在油菜遗传多样性研究中的应用。【方法】用8份有代表性的油菜资源,从SRAP和SCoT标记中各筛选出40对扩增条带清晰、多态性高的引物和40对SSR核心标记,对43份抗菌核病油菜育种亲本材料的遗传多样性进行分析,比较这3类标记在多态性(PPB)、多态性信息含量(PIC)及标记指数(MI)等方面的差异,最后依据材料两两间遗传相似系数,对43份油菜材料进行聚类分析。【结果】在位点检测能力方面以SCoT最高,每条SCoT引物可检测的平均条带数为9.3,其次为SRAP(8.6),SSR最少(7.3)。但多态性信息含量(PIC)则相反,SSR的PIC值最高(0.76),其次为SRAP(0.69),SCoT的PIC值最低(0.65)。基于SCoT、SSR和SRAP 3种分子标记的材料间遗传相似系数分别为0.43~0.87,0.56~0.84和0.46~0.83。聚类分析表明,SRAP标记聚类结果接近于3种分子标记混合统计的聚类结果。【结论】多态性位点检测能力和标记效率之间并无直接的相关性;3类标记在43份材料间的遗传距离显著不相关,研究每类分子标记在相应物种中的核心标记更为重要。