miR403分子进化特性及其在龙眼体胚发生早期的表达模式分析

编号 zgly0001673796

文献类型 期刊论文

文献题名 miR403分子进化特性及其在龙眼体胚发生早期的表达模式分析

作者 苏立遥  蒋梦琦  黄倏祺  徐小萍  厉雪  陈旭  赖钟雄  林玉玲 

作者单位 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2019年07期

年份 2019 

分类号 S667.2 

关键词 龙眼  microRNA403  进化特性  启动子  体胚发生  表达分析 

文摘内容 【目的】探究miR403的分子进化特性及其在龙眼体胚发生早期中的表达模式。【方法】根据龙眼转录组数据库结合miRBase数据库下载得到植物miR403成熟体（miRNA,MicroRNA）和前体（pre-miRNA,Precursor MicroRNA）序列,对其构建系统发育树、序列多重比对、前体二级结构分析;并克隆龙眼miR403 5’末端cDNA序列,比较miR403启动子顺式作用元件。利用qPCR（Quantitative real time-PCR）探究龙眼体胚发生早期miR403和pre-miR403的表达模式。【结果】龙眼及其他17个物种中miR403的36个前体和42成熟体序列的系统发育树以及序列多重比对显示,植物miR403高度保守且主要来源于pre-miR403的3臂,而pre-miR403分歧较大,序列仅在miRNA生成区域保守;不同物种之间miR403成员数量差异不大;pre-miR403最小折叠自由能为-35.70～-55.50 kal·mol-1。克隆获得龙眼primiR403（miR403初级体）5’末端cDNA序列,确认其第一个碱基A为转录起始位点（TSS,transcription start site）。龙眼等5种植物MIR403启动子中具有大量光、激素和逆境胁迫等元件。龙眼早期体胚发生过程中miR403和pre-miR403整体为显著下调趋势。【结论】龙眼miR403与其他植物miR403具有高度的保守性以及物种之间的特异性,miR403和pre-miR403下调表达可能有利于促进龙眼早期体胚发生。