龙眼miR166家族的分子进化特性及时空表达分析

编号 zgly0001561268

文献类型 期刊论文

文献题名 龙眼miR166家族的分子进化特性及时空表达分析

作者 林玉玲  张清林  曾友竞  陈晓慧  张梓浩  陈裕坤  赖钟雄 

作者单位 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2017年12期

年份 2017 

分类号 S667.2 

关键词 龙眼  miR166家族  进化特性  实时荧光定量PCR 

文摘内容 为了解miR166基因家族的分子进化特性及其在龙眼不同组织部位的表达规律,对龙眼miR166家族成员的成熟体和前体序列及其进化、前体二级结构预测、靶基因预测以及时空表达模式进行了分析。结果表明:龙眼miR166家族含有12条成熟体序列和7个前体序列（pre-miRNA）。Mfold预测显示pre-miR166家族7个成员的序列均能形成典型稳定的茎环二级结构,成熟序列的碱基保守性高,其他位置的则保守性减弱;它们的最小折叠自由能（ΔG）在–35.30–83.30kal·mol-1。系统发育进化树分析显示,龙眼pre-miR166家族与葡萄、碧桃的pre-miR166亲缘关系更为接近。靶基因预测显示,龙眼miR166基因家族靶基因包括同源异型域—亮氨酸拉链蛋白、三角状五肽重复结构蛋白、假定蛋白、DNA指导的RNA聚合酶Ⅲ亚单位RPC2、紫外线B受体等。实时荧光定量PCR显示,pre-miR166家族不同成员在龙眼生长发育进程中均有表达且表达模式不尽相同,提示其可能广泛参与龙眼各个器官的调控,且在功能上可能具有分工。