miR171家族成员分子特性及miR171b调控靶标在龙眼体胚发生早期的表达分析

编号 zgly0001651483

文献类型 期刊论文

文献题名 miR171家族成员分子特性及miR171b调控靶标在龙眼体胚发生早期的表达分析

作者 苏立遥  张帅  陈旭  徐小萍  赖钟雄  林玉玲 

作者单位 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 S667.2 

关键词 龙眼  miR171  分子特性  SCL6  激素响应  体胚发生 

文摘内容 【目的】研究龙眼miR171家族的分子特性及miR171b调控靶标对GA3、2,4-D的响应和在龙眼体胚发生早期的表达模式。【方法】通过龙眼基因组和转录组数据库筛选得到龙眼miR171成熟体与前体序列,基于邻近法（neighborjoining,NJ）利用MEGA 7.0以及iTOL进行系统发育树的构建以及序列多重比较分析;psRNAtarget预测龙眼miR171家族靶基因,利用改良的RLM-RACE验证靶基因裂解位点;利用qPCR分析不同浓度2,4-D、GA3处理的龙眼胚性愈伤组织（EC）及龙眼体胚发生早期miR171b与其靶基因SCL6（Scarecrow-like）的表达模式。【结果】分子特性分析提示,龙眼miR171各成员之间的进化关系较远,进化来源复杂,进化速率具有差异性;靶基因预测显示miR171家族靶基因主要包括SCL6、SCL15、SCL27、转录剪切体X2和RNA依赖的RNA聚合酶1等;裂解位点验证表明miR171b可以靶向切割SCL6,同时SCL27具有结合位点之外的切割位点。在不同浓度2,4-D和GA3处理下,miR171b与SCL6的表达趋势基本呈现为负调控模式;随着2,4-D浓度的升高,miR171b的转录水平总体呈下调趋势,SCL6的表达量总体呈上调趋势;GA3的存在显著下调miR171b的转录水平,而SCL6的表达量分别在2.5和12.5 mg·L-1GA3时达到最高值和最低值。龙眼早期体胚发生前期（0～6 d）,miR171b与SCL6表达模式相似,龙眼早期体胚发生后期（6～12 d）,miR171b显著下调,SCL6显著上调,提示大量积累的SCL6对龙眼球形胚（GE）形态建成具有重要作用,而miR171b通过减少转录产物的积累促进SCL6表达。【结论】miR171具有物种间的保守性以及成员间的差异性,同时miR171b及其靶标SCL6通过响应激素调节龙眼早期体胚发生的形态建成。