低温胁迫下枇杷幼果转录组的De novo组装和功能注释

编号 zgly0000890288

文献类型 期刊论文

文献题名 低温胁迫下枇杷幼果转录组的De novo组装和功能注释

学科分类 220.45;经济林学

作者 杨伟  龚荣高  石佳佳  赖静  廖明安  梁国鲁 

作者单位 四川农业大学园艺学院  成都龙泉驿区农村发展局  西南大学园艺园林学院 

母体文献 西北农林科技大学学报;自然科学版 

年卷期 2014(8)

页码 138-146

年份 2014 

关键词 枇杷幼果  低温胁迫  转录组  Illumina测序 

文摘内容 【目的】分析低温胁迫下枇杷幼果的转录组,以探讨幼果冻害的分子基础,为深入鉴定枇杷果实生长发育、抗寒性基因和抗寒蛋白提供资料。【方法】以花后75d的大五星枇杷幼果为试材,研究低温胁迫(3℃条件下处理12h)下幼果转录组的De novo组装和功能注释,并对其进行生物学信息分析,探索基因表达差异。【结果】低温胁迫下枇杷幼果通过De novo组装产生116 723条contigs,并应用Illumina高能量测序技术得到64 814条unigenes,其中有42 830条被nr、KEGG、COG、GO注释。此外,组装和注释了4 017个枇杷幼果在低温胁迫下表达的差异基因。