小麦钙网蛋白基因TaCRT-A多态性及其定位

编号 zgly0000807872

文献类型 期刊论文

文献题名 小麦钙网蛋白基因TaCRT-A多态性及其定位

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 王计平  毛新国  李润植  景蕊莲 

作者单位 中国农业科学院作物科学研究所农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室 

母体文献 应用生态学报 

年卷期 2012(9)

页码 2536-2542

年份 2012 

分类号 S512.1 

关键词 小麦  TaCRT-A基因  单核苷酸多态性  单倍型  抗旱性  遗传定位 

文摘内容 以苗期抗旱性不同的37份六倍体普通小麦(AABBDD)、3份A基因组材料(AA)和3份四倍体小麦(AABB)为材料,通过直接测序法检测TaCRT-A基因的单核苷酸多态性,分析该基因多态性与小麦苗期抗旱性的关系,并进行遗传定位.结果表明: TaCRT-A基因DNA长度为3887bp,在总长度为167141bp的核苷酸序列中共检测到202个核苷酸变异位点,其中包括165个SNP和37个InDel,二者出现的频率分别为1/1013bp和1/4517bp.编码区的核苷酸多样性π值小于非编码区,编码区所承受的选择压力较大.43份试材可分为14种单倍型,其中H1、H2和H13分别含有普通小麦二倍体野生近缘种A基因组供体种的1份材料,H6、H7分别包含抗旱性极强的1份材料,H8包含四倍体波斯小麦并同时包含抗旱材料与干旱敏感材料,H11主要包括强抗旱材料与中等抗旱材料;虽然TaCRT受水分胁迫诱导表达,但TaCRT-A基因的结构多态性分析未能揭示其多态性与小麦苗期抗旱性之间的直接关系;利用RIL群体(Opata 85×W7984)将该基因定位于3A染色体标记Xmwg30～Xmwg570之间,遗传距离分别为10.5cM和49.6cM.