水稻抗坏血酸氧化酶基因家族生物信息学分析

编号 zgly0001693887

文献类型 期刊论文

文献题名 水稻抗坏血酸氧化酶基因家族生物信息学分析

作者 柯笑楠  胡海超  黄霞  贾玉芳 

作者单位 浙江农林大学农业与食品科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S511 

关键词 水稻(Oryzasativa)  AAO  基因家族  生物信息学分析 

文摘内容 抗坏血酸氧化酶(ascorbic acid oxidase, AAO)是多铜氧化酶家族中的一员,在植物生长发育过程中起重要作用。为深入研究水稻AAO基因家族的功能特征及表达模式,采用生物信息学从Phytozome的水稻数据库鉴定出14个AAO成员,并对其染色体定位、蛋白理化性质及二级结构、基因结构、保守基序、系统发生树和表达模式等方面进行预测分析。结果显示,14个OsAAO不均匀地分布在8条染色体上,多为碱性蛋白;蛋白二级结构以无规则卷曲为主要组成部分;基因结构和保守基序分析表明,OsAAO内含子数目变化差异较大,但氨基酸序列具有较强的保守性;系统发生树可分为3个亚家族,OsAAOs与玉米、高粱簇在一起,亲缘关系较近;另外表达模式分析发现,OsAAO在不同的组织部位表达水平具有差异,这表明其行使功能不同。这些结果为今后研究该基因家族的生物学功能和培育耐旱品种提供理论依据。