红肉枇杷和白肉枇杷果实成熟不同阶段的比较转录组研究

编号 zgly0001566379

文献类型 期刊论文

文献题名 红肉枇杷和白肉枇杷果实成熟不同阶段的比较转录组研究

作者 陈栋  宋海岩  龚荣高  李靖  涂美艳  江国良  孙淑霞  汤浩茹 

作者单位 四川农业大学园艺学院  四川省农业科学院园艺研究所农业部西南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S667.3 

关键词 枇杷  果肉颜色  类胡萝卜素  比较转录组分析 

文摘内容 本研究对红肉枇杷和白肉枇杷在果实转色到成熟间的4个时期(授粉后第171天,第175天,第180天,第185天)样本进行转录组测序。除去低质量数据后共得到约9.5 Gb的Clean reads,组装出61 587条Unigenes。在阈值为|log2 Ratio|≥1和Probability>0.8时,共检测到28 216个Unigenes(13 676个上调和14 540个下调)差异表达。Gene Ontology(GO)和KEGG分析表明有40个GO类别和121代谢通路显著富集,涉及次级代谢物合成、植物激素信号传导、氧化磷酸化、糖酵解、淀粉与蔗糖代谢、氨基糖与核糖代谢等。此外从中鉴定出21个与类胡萝卜素代谢相关的基因,大部分基因在授粉后171 d时在红肉枇杷果肉中的表达量要显著高于白肉枇杷。研究结果为枇杷果肉颜色形成机制的阐明和枇杷遗传改良育种提供了理论依据。