大白菜KASP反应体系的优化与建立

编号 zgly0001655255

文献类型 期刊论文

文献题名 大白菜KASP反应体系的优化与建立

作者 杨双娟  原玉香  魏小春  王志勇  赵艳艳  姚秋菊  张晓伟 

作者单位 河南省农业科学院园艺研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 S634.1 

关键词 大白菜  KASP  反应体系优化 

文摘内容 以大白菜基因组DNA为模板,对影响竞争性等位基因特异性PCR（Kompetitive allele specific PCR,KASP）的反应体积、引物浓度和DNA模板用量等3个参数进行优化,建立了适用于大白菜的KASP反应体系。96孔模块最佳反应体系中,总反应体积为8μL,其中模板DNA(60～80 ng·μL-1)1μL,KASP Master mix（2×）4μL,引物混合物(50μmol·L-1)0.14μL,ddH2O 3μL。384孔模块最佳反应体系中,总反应体积为4μL,其中模板DNA(60～80 ng·μL-1)1μL,KASP Master mix（2×）2μL,引物混合物(50μmol·L-1)0.07μL,ddH2O 1μL。利用不同引物和不同的大白菜材料对优化的反应体系进行验证,均获得了较好的KASP-SNP分型,验证了该优化体系的稳定性。该反应体系可以用于大白菜遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱构建等遗传学研究。