毛竹β-1,3-葡聚糖酶基因的克隆及序列分析

编号 zgly0000655464

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹β-1,3-葡聚糖酶基因的克隆及序列分析

学科分类 220.3010;森林病理学

作者 张艳  高健  徐有明 

作者单位 国际竹藤网络中心  华中农业大学园艺与林学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2010,8(3)

页码 533-541

年份 2010 

分类号 S565.4 

关键词 毛竹  β-1  3-葡聚糖酶基因  基因克隆  序列分析  表达载体 

文摘内容 β-1,3-葡聚糖酶是一种植物病程相关蛋白,在植物抵御病害中有重要作用。本研究以毛竹为实验材料,利用RACE技术,克隆毛竹β-1,3-葡聚糖酶基因的外显子序列,并在β-1,3-葡聚糖酶基因的编码区两端设计引物,以毛竹基因组DNA为模版扩增该基因的内含子序列。序列结果表明,该基因全长1693bp,包含两个外显子和一个内含子,命名为PheGLU(GenBank登录号GU238236)。该基因包含1个996bp的开放阅读框,编码332个氨基酸,相对分子质量为3.541×104Da,其等电点pI为6.389,是一个酸性蛋白且分泌到胞外;其中,该蛋白的二级结构中包含35.15%的α-螺旋,21.82%的β-转角,43.03%的延伸链和无规则卷曲等;三级结构同源建模预测显示,它与大麦β-1,3-葡聚糖酶(PDB number: 1ghsA)具有80.4%的同源性;聚类分析显示,该基因序列与已报道的其它植物具有较的高氨基酸序列同源性。本研究为进一步鉴定毛竹β-1,3-葡聚糖酶基因的抗真菌病害能力奠定了基础。