链孢粘帚霉寄生核盘菌菌核相关基因的EST生物信息学分析

编号 zgly0001399438

文献类型 期刊论文

文献题名 链孢粘帚霉寄生核盘菌菌核相关基因的EST生物信息学分析

作者 钟增明  李世东  高会兰  孙漫红 

作者单位 中国农业科学院植物保护研究所/农业部生物防治重点开放实验室 

母体文献 中国生物防治学报 

年卷期 2011年02期

年份 2011 

分类号 S476.8 

关键词 链孢粘帚霉  核盘菌  菌寄生  EST  寄生相关基因 

文摘内容 链孢粘帚霉Gliocladium catenulatum是一种重要的菌寄生真菌,为了明确该菌与寄主核盘菌Sclerotinia sclerotiorum互作中参与菌寄生过程的功能基因,本实验室前期采用抑制消减杂交技术(SSH)构建了消减cD-NA文库。本文从该库里随机挑选420个阳性克隆进行测序分析,结果表明克隆片段大小在200~600bp的序列占81.07%。去除载体和小于100bp的序列,获得391条有效序列,其平均长度为409bp。通过序列拼接得到181个单值基因(unigenes),其中包括27个重叠群(contigs)和154个单拷贝的ESTs(singletons)。将得到的ESTs与NCBI非冗余蛋白数据库(NR)进行BLASTx分析,结果显示有38个基因的编码蛋白与已知功能的蛋白有较高的相似性,其中包括可能与生物防治功能相关的内切葡聚糖酶、脂滴包被蛋白、MFS转运蛋白、过氧化物酶等;有39条序列在NCBI数据库中未找到相似序列,可能为新基因;其他基因的编码蛋白与数据库中功能未知蛋白相似性高。本研究为明确与重寄生功能相关的基因奠定了基础。