两种纺织娘线粒体基因组的比较分析

编号 zgly0001459736

文献类型 期刊论文

文献题名 两种纺织娘线粒体基因组的比较分析

作者 周志军  杨明茹  常岩林  石福明 

作者单位 河北大学生命科学学院  北京军区总医院生物治疗中心 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2013年04期

年份 2013 

分类号 Q963 

关键词 直翅目  螽斯科  纺织娘  日本纺织娘  线粒体基因组  序列分析 

文摘内容 目前关于螽斯科昆虫的线粒体基因组全序列及其分子进化的研究报道很少。本研究利用L-PCR技术结合嵌套步移PCR扩增获得纺织娘Mecopoda elongata和日本纺织娘M.niponensis的线粒体基因组全序列,同时对二者之间的碱基组成和结构特点进行了比较分析。结果显示:纺织娘线粒体基因组(GenBank登录号JQ917910)序列全长15284bp,A+T含量71.8%;日本纺织娘线粒体基因组(GenBank登录号JQ917909)序列全长15364bp,A+T含量72.4%;2种纺织娘序列长度差异主要是控制区长度不同引起(纺织娘控制区长294bp,日本纺织娘控制区长393bp)。2种纺织娘基因组基因含量、相对位置及转录方向均与其他已报道的螽斯科昆虫一致,未发现基因重排现象;基因组中均存在较长的间隔序列,在trnA/trnR之间的间隔序列长度分别为63bp与68bp,在trnQ/trnM之间的分别为55bp和26bp,在trnSUCN/nad1之间的均为21bp。而最长的基因重叠区域在2种纺织娘trnC/trnW之间均为8bp,在atp8/atp6和nad4L/nad4L之间均为7bp。蛋白质编码基因的碱基组成和密码子使用均具有明显的偏倚性;除nad1和nad2以特殊的TTG作为起始密码子,cox1使用特殊的起始密码子ATGA外,其余的10种蛋白质编码基因均使用典型的ATN作为起始密码子。在tRNA基因中,除trnSAGN外,均能折叠形成典型的三叶草形二级结构。在这些tRNA基因中均存在一定数目的以G-U错配为主的碱基错配,类似现象同样存在于其他已测定的六足动物线粒体基因组中,表明G-U配对在线粒体基因组中很可能是一种完全正常的碱基配对方式。基因组中控制区的A+T含量略低于线粒体基因组的其他区域,表明高A+T含量并不是该区域的必要特征。本研究结果为螽斯科系统发生关系重建积累了有价值的数据资料。