马尾松PmTIR1基因的克隆及编码蛋白质的结构预测

编号 zgly0001496226

文献类型 期刊论文

文献题名 马尾松PmTIR1基因的克隆及编码蛋白质的结构预测

作者 苏江  郭天玮  季孔庶 

作者单位 南京林业大学南方现代林业协同创新中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015年06期

年份 2015 

分类号 S791.248 

关键词 马尾松  生长素  TIR1(transport inhibitor response 1)  序列分析  结构预测 

文摘内容 TIR1(transport inhibitor response 1)基因在生长素信号转导途径中发挥重要作用。本研究采用PCR技术和RACE技术,利用Primer Premier5进行引物设计,从马尾松中克隆出TIR1基因的全长c DNA序列,命名为Pm TIR1。此c DNA全长2 446 bp,包括1 725 bp完整的ORF,能够编码含有574个氨基酸的蛋白,此蛋白相对分子质量为64 240.3 u,等电点为6.76。利用Clustal X、ANTHEPROT和DNAMAN等软件分析Pm TIR1序列及其编码的氨基酸序列,结果表明:马尾松Pm TIR1蛋白氨基酸序列与火距松TIR1蛋白同源性高达99%,Pm TIR1蛋白含有F-box结构域和多个LRR结构域;Pm TIR1蛋白的F-box结构域可能与SCFTIR1中SKP1结合,它符合F-box家族的特点。利用实时定量技术得知Pm TIR1在马尾松嫩根、嫩茎、嫩叶中都有表达,在嫩叶中表达量最高、嫩根中次之、嫩茎中最低。本研究可为生长素调控马尾松生长发育相关机理提供理论依据。