白及丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)基因的序列分析

编号 zgly0001648639

文献类型 期刊论文

文献题名 白及丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)基因的序列分析

作者 沈访  李林  潘胤池  张社波  马激  徐德林 

作者单位 遵义医学院附属医院  遵义医学院细胞生物学教研室 

母体文献 植物研究 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S567.239 

关键词 白及  丝氨酸羟甲基转移酶  序列分析  结构预测 

文摘内容 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞光合作用和一碳代谢的关键酶之一,研究SHMT基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义。从白及转录组数据库中分离得到SHMT基因(NCBI登录号:MG544187),运用生物信息学软件对该基因进行序列分析。结果显示:该基因长度为1 953 bp,编码的蛋白质长度为471aa、分子量为51.861 06 k D、理论等电点为7.17,SHMT二级结构主要由无规则卷曲结构和α螺旋结构组成,核苷酸和氨基酸序列与铁皮石斛SHMT相似性最高,达93%,结构域分析发现该蛋白具有高度保守结构域,三级结构预测为四聚体结构,跨膜区及信号肽分析发现该蛋白无跨膜区及信号肽,亚细胞定位分析发现该蛋白主要位于细胞质、叶绿体亚细胞器位置。本分析结果为白及SHMT的应用研究提供了基础数据,也为植物SHMT基因的分子研究提供了理论依据及基础资料。