福建NADC30-like PRRSV FJLY01株的全基因组分子特征分析

编号 zgly0001569372

文献类型 期刊论文

文献题名 福建NADC30-like PRRSV FJLY01株的全基因组分子特征分析

作者 魏春华  刘建奎  戴爱玲  龚丽贞  李晓华  黄思琼  杨小燕 

作者单位 龙岩学院生命科学学院福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室福建省生猪疫病防控工程技术研究中心 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S852.65 

关键词 PRRSV  全基因组  NADC30-like  福建省 

文摘内容 【目的】了解福建省NADC30-like PRRSV FJLY01株的分子生物学特征和遗传演化规律,为PRRSV的防控提供参考。【方法】对采自福建省规模化猪场的疑似病料进行PRRSV分离鉴定,以NADC30PRRSV毒株基因序列为参考设计并合成9对引物,分别对分离株序列进行分段PCR扩增,经克隆测序后进行序列拼接,采用MEGA 6.0软件进行核苷酸及氨基酸同源性比对,并绘制其与其他35株毒株的系统遗传进化树。【结果】FJLY01株基因组全长为15 016bp(不包含polyA),包含10个开放阅读框,5′-UTR长190bp,3′-UTR长148bp,Nsp2基因缺失393bp。Nsp2蛋白存在类似PRRSV MN184和NADC30株的131个氨基酸的缺失。核苷酸比对结果表明,FJLY01株与VR-2332、MLV RespPRRS/Repro、CH-1a和BJ-4株核苷酸的同源性为85.2%~86.3%,与JXA1、HuN4等HP-PRRSV株核苷酸的同源性为83.7%~84.1%,与MN184A、MN184B株核苷酸的同源性为87.9%~88.2%,与NADC30株核苷酸的同源性最高,为97.1%。系统进化树分析表明,该毒株属于NADC30-like毒株,与JXA1、VR2332和CH-1a的亲缘关系较远。【结论】福建省存在NADC30-like毒株,应该加强PRRSV的监测。