结球甘蓝CML家族基因及其在授粉后柱头中的表达

编号 zgly0001651745

文献类型 期刊论文

文献题名 结球甘蓝CML家族基因及其在授粉后柱头中的表达

作者 蒲敏  罗绍兰  廉小平  曾静  张贺翠  刘倩莹  左同鸿  朱利泉 

作者单位 西南大学农学与生物科技学院  涪陵第十四中学校  重庆市蔬菜重点实验室  长江师范学院生命科学与技术学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 S635.1 

关键词 甘蓝  CML家族基因  生物信息学  表达分析 

文摘内容 利用NCBI和甘蓝基因组数据库筛选获得了76个结球甘蓝CML家族基因,其随机分布在甘蓝的9条染色体上,染色体上最多的有12个基因,最少有1个基因。分析发现该基因家族编码蛋白氨基酸残基长度在109～365个之间,分子量大多在20 kD左右,为小分子蛋白,且均含有2～4个保守的EF-hand结构域。甘蓝的76个CML基因依据与拟南芥的CML家族的进化关系及序列相似性分为Ⅰ～Ⅷ个亚家族,每个亚家族基因有较高的同源性,进化关系较近。经亚细胞预测分析发现大部分蛋白在质膜和胞外表达,少量在质膜、细胞核内和叶绿体等部位表达。数字表达谱分析发现在76个基因中,有25个基因在自花和异花授粉后差异表达,其中BoCML12、BoCML42、BoCML44、BoCML45、BoCML60、BoCML70、BoCML71和BoCML74等8个基因在自花和异花授粉后表达趋势有较大差异,表明这8个基因以不同的方式参与调控甘蓝自花和异花授粉后的反应过程,有可能与甘蓝的自交不亲和性相关。