甘蓝PMEI家族基因结构、基因组分布和表达分析

编号 zgly0001682210

文献类型 期刊论文

文献题名 甘蓝PMEI家族基因结构、基因组分布和表达分析

作者 白晓璟  王玉奎  左同鸿  刘倩莹  廉小平  张贺翠  张以忠  蒲敏  罗绍兰  朱利泉 

作者单位 西南大学农学与生物科技学院  西南大学园艺园林学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年10期

年份 2019 

分类号 S635 

关键词 甘蓝  BoPMEI基因家族  生物信息学  表达分析 

文摘内容 为了弄清甘蓝PMEI家族基因成员数、基因结构和分布及其与自交不亲和性的关系,利用转录组测序和相关生物信息学方法对其进行了基因结构分析和全基因组鉴定,对家族基因进行了表达谱分析,并通过实时荧光定量PCR技术验证了基因的表达情况。结果表明,甘蓝中PMEI家族包含101个基因,分为11组,其成员不均匀分布在9条染色体上,主要通过全基因组三倍体复制(wholegenome triplication,WGT)和串联复制事件进行倍增,与拟南芥在1 556万年前发生分化。数字表达谱分析发现在101个基因中,BoPMEI56、BoPMEI54、BoPMEI32、BoPMEI29、BoPMEI78、BoPMEI30、BoPMEI57、BoPMEI58和BoPMEI84这9个基因在自花和异花授粉后表达趋势有明显差异。荧光定量PCR结果显示,其在自花授粉和异花授粉的表达变化趋势与转录组分析结果基本一致。这些结果表明:BoPMEI家族的101个成员中,可能至少有9个基因以不同方式参与调控甘蓝自花和异花授粉后的反应过程,可能与甘蓝自交不亲和性有关。