毛竹基因组中热激蛋白HSP90基因家族的鉴定与分析

编号 zgly0001739835

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹基因组中热激蛋白HSP90基因家族的鉴定与分析

作者 陈思睿 

作者单位 St.Aidan′s Anglican Girls′School 

母体文献 福建林业科技 

年卷期 2022,49(1)

页码 7-14

年份 2022 

分类号 S795.7  Q78 

关键词 毛竹  HSP90家族基因  组织特异性  表达分析 

文摘内容 为深入了解毛竹中的热激蛋白(heat shock protein,HSP)及其特性,借助生物信息学工具对毛竹HSP90家族基因进行鉴定,分析其理化性质、结构特征、系统进化关系以及组织特异性表达模式。结果表明,毛竹基因组中含11个HSP90家族基因,分布于9条scaffold上,外显子5~20个不等;系统进化关系分析显示毛竹11个HSP90家族基因分属于3组,结构特征相似的成员分属于同一组;共线性分析表明毛竹中仅有1个HSP90基因(PH02Gene09089)与水稻的HSP90基因不存在共线性关系;亚细胞定位结果显示毛竹HSP90蛋白定位于细胞质或内质网中;HSP90家族成员启动子上分布有丰富的与激素、光照、及逆境相关的顺式作用元件;已发表的转录组数据及RT-PCR结果表明,HSP90家族各基因在不同组织中的表达模式不同。本研究结果加深了对毛竹HSP90基因家族的了解,可为研究该家族基因的生物学功能及后续利用提供参考。