偶蹄动物朊蛋白基因变异性和其系统发生关系分析

编号 zgly0000409339

文献类型 期刊论文

文献题名 偶蹄动物朊蛋白基因变异性和其系统发生关系分析

作者 吴润  陈怀涛  谢庆阁 

作者单位 中国农业科学院兰州兽医研究所/农业部畜禽病毒学重点实验室  甘肃农业大学动物医学院 

母体文献 中国农业科学 

年卷期 2006,39(6)

页码 1253-1263

年份 2006 

分类号 S855.3  Q959.62 

关键词 偶蹄动物  朊蛋白基因  结构特征  分子进化  结构与功能的关系  种间屏障 

文摘内容 [目的]为明了偶蹄动物PrP基因的结构特征及其变异与结构、功能和朊粒病传染种间屏障的关系以及系统发生关系;[方法]利用DNAstar和Clustalx程序及treev32软件进行了22种偶蹄动物的43个完整PrP基因序列的同源性分析、多重排比和进化树构建;[结果]不同种属偶蹄动物的PrP基因完整ORF大小有所差异,范围为768～795 bp,可编码255～264个氨基酸的朊蛋白。核苷酸和氨基酸序列的同源性,偶蹄动物间≥88.6%和≥93.3%,反刍动物间≥95.4%和≥96.5%.共发现40个点突变和2个突变区。在N-端柔韧无序＂尾＂区(25～135)以八肽重复缺失为主,球形结构域区(136～241)以点突变为主,点突变主要簇聚在S1 (-折叠前的柔韧无规卷曲区的C-端部分和HC (-螺旋内。氨基酸104～135区和球形结构域区存在有8个高突变位点。已知PrP肽基元和功能位点如芳烃回文序列基元、2个N-连接糖基化位点、2个苏氨酸磷酸化位点、1个酪氨酸硫化位点、形成二硫键的2个半胱氨酸以及GPI锚锚着点丝氨酸为偶蹄动物所共有,各种间变异体的各结构模式非常一致。进化关系分析,可将偶蹄动物PrP基因区分为3大类,反刍动物PrP基因分为3小类。令人意外的是,2个双峰驼PrP基因的进化关系与牛属动物基因同源。[结论]偶蹄动物的PrP基因是一个保守基因,氨基酸104～135区和球形结构域区内的8个高突变位点可能是影响分子间相互作用、形成朊粒病传染种间屏障的主要位点,物种间各氨基酸变异并不影响PrP的主要结构和功能。