牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用

编号 zgly0001528227

文献类型 期刊论文

文献题名 牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用

作者 杨勇  王顺利  薛璟祺  任秀霞  李丹丹  杨若雯  曾秀丽  张秀新 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室  四川农业大学玉米研究所农业部西南玉米生物学与遗传育种重点实验室  西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S685.11 

关键词 牡丹  管家基因  系统发生  进化 

文摘内容 利用RT-PCR技术从牡丹组7个野生种和1个栽培种中分别克隆得到泛素延伸蛋白基因(ubiquitin,UBI)、素环蛋白基因(cyclophilin,CYP)、肌动蛋白基因(Actin)、葡萄糖六磷酸脱氢酶基因(glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase,G6PD)和β–微管蛋白基因(beta-tubulin,TUB)等5个管家基因的编码序列(coding sequence,CDS)。序列比对分析发现,5个管家基因序列均相对保守,其在牡丹7个野生种和1个栽培种中的保守性在99.04%~99.69%。利用5个管家基因分别构建了其在牡丹组8份材料中的系统进化树。5个系统进化树均将8份材料分成两组,即革质花盘亚组和肉质花盘亚组;由于5个管家基因核苷酸序列各自的保守性不同,在区分亚组成员间略有差异。综合分析5个管家基因构建的系统进化树可知,杨山牡丹(Paeonia ostii)和栽培牡丹(P.suffruticosa‘Luoyanghong’)常聚为一支,二者亲缘关系较近,因而推测杨山牡丹可能参与了栽培牡丹的形成;紫斑牡丹(P.rockii)和四川牡丹(P.decomposita)一直聚为一支,推测二者亲缘关系较近;黄牡丹(P.lutea)和紫牡丹(P.delavayi)一直聚为一支,推测这二者亲缘关系较近。狭叶牡丹(P.potaninii)与黄牡丹和紫牡丹分化较早,结合前人研究结果建议将狭叶牡丹作为一个独立的种。