基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析

编号 zgly0001577198

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析

作者 李焕苓  田婉莹  孙进华  张新春  张蕾  王果  王树军  王家保 

作者单位 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S667.1 

关键词 荔枝  SSR  InDel  遗传多样性 

文摘内容 为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位,摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题;本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记,利用这些标记对232份荔枝种质资源进行了遗传多样性研究;取6个荔枝品种DNA为模板,筛选出18对SSR引物和12对InDel引物应用于遗传多样性研究,检测到基因位点141个,等位基因变异数范围为2~11个,平均4.70个,多态性位点为139个,多态性位点比率是98.58%。UPGMA聚类分析发现,232份荔枝种质资源的遗传相似系数是0.66~1.00;发现SSR引物的多态性大于InDel引物;在遗传相似系数为0.76处,供试材料分为15类,多数来自海南的荔枝资源能一起聚类,海南11份野生荔枝资源分别聚类在5个类群中,说明海南野生荔枝资源的遗传多样性较丰富。研究将为进一步开展荔枝遗传改良和育种提供依据。